Национальный музей Уфы, является одним из старейших в России. На сегодняшний день в фондах национального музея Уфы хранится более 130 тысяч экспонатов подлинных памятников материальной и духовной культуры.
В музее имеется 4 отдела: природы, археологии, истории края, этнографии.
Экспозиция национального музея располагается в 34 залах.
В фондах ЦЭИ УНЦ РАН собраны крупные коллекции по всем периодам древней, средневековой и современной истории Южного Урала, по культуре и быту народов края. Экспозиции сопровождаются картами, схемами, планами, фотографиями, графическими реконструкциями, которые позволяют посетителям получить насыщенную и полноценную информацию. Музей и Центр стали комплексной научной, методической и методологической базой развития этнографии в Башкортостане и в сопредельных регионах Урало-Поволжья. Сегодня МАЭ представляет собой крупнейшее хранилище археологических (127 тыс. ед.хр.), этнографических (3,0 тыс. ед.хр.) и антропологических (1,2 тыс.ед.хр.) коллекций.
